顺治十四年，华亦祥参加丁酉科乡试，得中举人。顺治十四年初，皇帝下令限制满族八旗子弟参加会考，以后平西王、靖南王、定南王、采南王等四王子弟及续顺公下属子弟，虽不隶属清八旗，也都禁止参加考试。顺治十六年，华亦祥入会试中式，会元是朱锦。殿试，顺治帝赐他一甲第二名进士，授翰林院编修。该科状元是徐元文。
华亦祥的父亲是华敷施，不仅教育孩子学问，而且“严孝敬，恤族闾”。华亦祥自幼有良好家教。顺治十八年，华亦祥任会试同考官。历任迁翰林院侍读，以文学启渥被皇帝所知遇。华亦祥事亲极为孝敬，对家人、内族不论行为曲直，全都淳厚相待，关怀倍至。据《常州府志》记载：“曲沃天伦，尤恤乡旧”，备至。累迁弘文院侍读学士，不久，华亦祥去世。他去世时，清廉到无以成殓的程度。全凭他的同年鼎甲，昆山的徐元文和长洲的叶方蔼为他经纪丧葬事宜。
华亦祥居家孝友，周济宗党之急。闻听江南的人有抗粮事，邑里有诸位士子因此而被逮押入京师的，他多方委托、安顿路上需要。华亦祥私下还为乡里人想办法、维护体恤他们、使众人各得保全，并且助资使大家回归故乡。众人以德称颂他。